Con el inicio de la vacunación contra el COVID-19, la Contraloría General comenzó un proceso de seguimiento a los planes y cronogramas de inmunización en todo el país. El Contralor delegado para la participación ciudadana, Luis Carlos Pineda manifestó que el programa busca que el proceso se desarrolle de manera más eficiente. Dijo que el control se efectuará en los 32 departamentos con la idea de vigilar el proceso de acopio de las vacunas y la aplicación de las inmunizaciones por parte de las IPS, para establecer claramente cómo funcionan estas rutas de vacunación.
De acuerdo con el Organismo de Control Fiscal el proceso comenzó en firme en las ciudades de Sincelejo y Montería, en donde comenzó en firme el proceso de vacunación contra el COVID-19.